Si Dr. Arindam Ghatak mula sa Unibersidad ng Vienna ay nagsagawa ng high-throughput proteomics profiling ng Desiree potato variety upang makakuha ng walang pinapanigan na komprehensibong larawan ng mga pagbabago sa potato proteome (ang kabuuan ng lahat ng protina na naroroon) bilang tugon sa iba't ibang sitwasyon ng stress.
Ang mga halaman ay nilinang sa isang pilot experiment sa PSI na nakabase sa Czech Republic, isang kasosyo sa proyekto.
Ang lahat ng mga protina ay ihiwalay at pre-fractionated para sa masalimuot na pagsusuri na ito bago matunaw at sumailalim sa mass spectrometry, na nagbibigay-daan para sa pagtuklas ng daan-daang iba't ibang mga protina sa isang solong sample at, bilang karagdagan, ang dami ng kanilang kasaganaan. Ang software ng Proteome Discoverer ay ginamit noon upang pag-aralan ang mga nakolektang data (Thermo, Germany). Ang mga protina ay nakilala gamit ang Solanum internal curated database (binuo ng NIB Institute, Ljubljana, Slovenia).
Mula sa harvest 1 (isang araw pagkatapos ng stress) at harvest 3 sa kabuuan, 10341 na protina ang natagpuan (8 araw pagkatapos ng stress). Sa ani 1, ang waterlogging stress ay kung saan nakita ang pinakamataas na modulasyon ng proteome. Dito, ang mga protina na kasangkot sa pagbibigay ng senyas, metabolismo ng lipid, at pagbubuklod ng RNA ay nagpakita ng pagtaas ng aktibidad kumpara sa mga kontrol. Katulad nito, sa panahon ng stress ng init kumpara sa mga kontrol, ang mga protina na kasangkot sa photosynthesis at pangalawang metabolismo ay nadagdagan, na nagpapakita ng mekanismo ng pagtugon sa stress ng proteome.
Alinsunod sa ani 1, ang ani 3 ay nagpakita din na ang waterlogging stress, init, at ang pinagsamang epekto ng init at tagtuyot ay ang mga stress na nakilala ang pinakamalakas na regulasyon ng proteome. Sa paghahambing sa mga kontrol at iba pang mga stress, ang 14-3-3 signaling ay nakataas sa ilalim ng waterlogging stress, na nakakaapekto sa mga protina na inuri bilang kabilang sa functional na kategorya ng metabolismo ng enerhiya.
"Batay sa paunang pagkilala, ang waterlogging at heat stress ay nagpakita ng pinakamatibay na regulasyon sa antas ng proteome kumpara sa iba pang mga stress. Gayunpaman, magiging kawili-wiling tingnan ang proteome ng yugto ng pagbawi kumpara sa iba pang mga punto ng oras ng pag-aani, lalo na sa panahon ng tagtuyot. Ang mas maraming data mining ay nagpapatuloy upang makakuha ng malalim na impormasyon tungkol sa mga mekanismo ng pagtugon sa stress ng mga halaman at yugto ng pagbawi sa iba't ibang patatas na Desiree, "ang isinulat ng mga siyentipiko.
Ang proyekto ng Horizon 2020 EU Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato (ADAPT), kung saan nakikilahok ang Europatat, ay naglalayong bumuo ng mga bagong estratehiya upang gawing akma ang mga patatas para sa mapaghamong lumalagong mga kondisyon sa hinaharap.
Isa sa mga pangunahing layunin ng proyekto ay imbestigahan ang mga pagbabago sa morphological, physiological, biochemical, at molekular ng patatas bilang tugon sa nag-iisa at pinagsamang init, tagtuyot, at waterlogging stress sa pamamagitan ng paggamit ng high throughput phenotyping at OMICS na teknolohiya (genomics, transcriptomics, proteomics, o metabolismo).
Isang mapagkukunan: https://www.potatobusiness.com